RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CAMK4Q16566 473 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SLFN13Q68D06 897 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MCTP2Q6DN12 878 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 RNF180Q86T96 592 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 DPP9Q86TI2 863 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PIGSQ96S52 555 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ANO10Q9NW15 660 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 FRYLO94915 3013 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PTPRSQ13332 1948 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 TET1Q8NFU7 2136 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SH3D21A4FU49 640 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 C19orf81C9J6K1 198 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ZNF202O95125 648 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 NDUFB10O96000 172 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CD4P01730 458 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ASNSP08243 561 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CCL23P55773 120 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CCNA1P78396 465 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SEPT2Q15019 361 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 HS1BP3Q53T59 392 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 LIPIQ6XZB0 460 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 NEK8Q86SG6 692 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CUL5Q93034 780 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MAML3Q96JK9 1138 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 AK8Q96MA6 479 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SDF4Q9BRK5 362 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 WHRNQ9P202 907 aa7.3□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 F5H6K3 240 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 NEMFO60524 1076 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 ASGR2P07307 311 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 TACR1P25103 407 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SOX9P48436 509 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 KCNC1P48547 511 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 STAT2P52630 851 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 KLRC3Q07444 240 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 TCEAL1Q15170 157 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CNNM3Q8NE01 707 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 SCLYQ96I15 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 CSRNP2Q9H175 543 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 VCPKMTQ9H867 229 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 TMX2Q9Y320 296 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PRR23AA6NEV1 266 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PROB1E7EW31 1015 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ARVCFO00192 962 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ADCY6O43306 1168 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MYL1P05976 194 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ADRB1P08588 477 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 OR52Z1P0C646 297 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 NCAM1P13591 858 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 POSTNQ15063 836 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 INF2Q27J81 1249 aa7.28□□□□□ -1.24
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