RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 PHF2O75151 1096 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 MICAL2O94851 1124 aa20.08■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 KCNE1P15382 129 aa20.08■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 XKR4Q5GH76 650 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.08■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 CAVIN3Q969G5 261 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 CAPNS2Q96L46 248 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 KLK14Q9P0G3 267 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.08■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 RNF186Q9NXI6 227 aa20.08■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.08■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 USTQ9Y2C2 406 aa20.08■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 TOMM70O94826 608 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 ASGR1P07306 291 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 DR1Q01658 176 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 PRELID2Q8N945 189 aa20.07■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 C18orf8Q96DM3 657 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 RNF39Q9H2S5 420 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 SYNCQ9H7C4 482 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 SCN1AP35498 2009 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 RPS6KA5O75582 802 aa20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 ELNP15502 786 aa20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 STILQ15468 1287 aa20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 SERINC5Q86VE9 423 aa20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 FSCN2O14926 492 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 TAS2R40P59535 323 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 DPH6Q7L8W6 267 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 SESTD1Q86VW0 696 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.06■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 TRADDQ15628 312 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 CYP1B1Q16678 543 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.05■□□□□ 0.8
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USP39-202ENST00000409025 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 RPAINQ86UA6 219 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 CPXM1Q96SM3 734 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 CTSHP09668 335 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 RARAP10276 462 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 KRT3P12035 628 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP39-202ENST00000409025 GPD2P43304 727 aa20.04■□□□□ 0.8
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