RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CEP57L1Q8IYX8 460 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TOP6BLQ8N6T0 577 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ACBD6Q9BR61 282 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LTB4R2Q9NPC1 389 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TGFB1I1O43294 461 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TNNC2P02585 160 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ATF6P18850 670 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GABRR2P28476 465 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MYL7Q01449 175 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MYO1EQ12965 1108 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 UBXN2BQ14CS0 331 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 WDR49Q8IV35 697 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MFSD6LQ8IWD5 586 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SCFD1Q8WVM8 642 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 BCO2Q9BYV7 579 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 BLZF1Q9H2G9 400 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 HEBP1Q9NRV9 189 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TCHHQ07283 1943 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SLFN14P0C7P3 912 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GLULP15104 373 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 VIPR2P41587 438 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 BMT2Q1RMZ1 405 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF852Q6ZMS4 543 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DPH6Q7L8W6 267 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 C1orf210Q8IVY1 113 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ATXN3LQ9H3M9 355 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SNX9Q9Y5X1 595 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MYO15AQ9UKN7 3530 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPRJQ12913 1337 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM170BA6NMN3 283 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 NCAM2O15394 837 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CASP1P29466 404 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CDC25CP30307 473 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GDI1P31150 447 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 AFMP43652 599 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LHX1P48742 406 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CUL4BQ13620 913 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TAF12Q16514 161 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FRMD5Q7Z6J6 570 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM84AQ96KN4 292 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GCNAQ96QF7 691 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCB6Q9NP58 842 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZMYM5Q9UJ78 669 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD54-203ENST00000407117 HEPACAM2A8MVW5 462 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 MAN2B1O00754 1011 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF263O14978 683 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 NELFCDQ8IXH7 590 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 C12orf56Q8IXR9 622 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGRF2Q8IZF7 708 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 XXYLT1Q8NBI6 393 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 MKNK1Q9BUB5 465 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 GABRDO14764 452 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 LRRN2O75325 713 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 CD72P21854 359 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 PCSK1P29120 753 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 WEE1P30291 646 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 STXBP5Q5T5C0 1151 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 HPDLQ96IR7 371 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 FNBP1Q96RU3 617 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 TMLHEQ9NVH6 421 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 OBP2AQ9NY56 170 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 USP25Q9UHP3 1055 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 SERTAD1Q9UHV2 236 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 PRR23AA6NEV1 266 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 CMA1P23946 247 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 KRT85P78386 507 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 FCHO2Q0JRZ9 810 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 PSMD6Q15008 389 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 GPR158Q5T848 1215 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 YAF2Q8IY57 180 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 CLDN23Q96B33 292 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 SEMA4AQ9H3S1 761 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 TASP1Q9H6P5 420 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 IL21Q9HBE4 155 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD54-203ENST00000407117 NCANO14594 1321 aa29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms