RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 KCNJ12Q14500 433 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 CLUL1Q15846 466 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 MAN2A1Q16706 1144 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 S1PR5Q9H228 398 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 FANCLQ9NW38 375 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 CDH9Q9ULB4 789 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 FAM50BQ9Y247 325 aa14.65□□□□□ -0.06
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 A8MXQ7 604 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PRRG1O14668 218 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 LRRN2O75325 713 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 CAVIN2O95810 425 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 C8AP07357 584 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TPM2P07951 284 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 WEE2P0C1S8 567 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF165P49910 485 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 VWA3BQ502W6 1294 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TTC39CQ8N584 583 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TATDN2Q93075 761 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SYT15Q9BQS2 421 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 APOL5Q9BWW9 433 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 BCO2Q9BYV7 579 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.64□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 MTMR11A4FU01 709 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 BECN2A8MW95 431 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 MBTPS2O43462 519 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SEC24AO95486 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 LRG1P02750 347 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 HOXA9P31269 272 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ASPAP45381 313 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 RAP1GAPP47736 663 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 DUSP4Q13115 394 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 FAM171BQ6P995 826 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 GBP6Q6ZN66 633 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 UNC93AQ86WB7 457 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TNIP3Q96KP6 325 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 NT5C1BQ96P26 610 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ASB2Q96Q27 587 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 SDCBP2Q9H190 292 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 NDST4Q9H3R1 872 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PIDD1Q9HB75 910 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.63□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 HCRTO43612 131 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 XYLBO75191 536 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 RFPL2O75678 378 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 MTHFRP42898 656 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 ALDH1A3P47895 512 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 LRMPQ12912 555 aa14.62□□□□□ -0.07
VPREB1-202ENST00000403807 NCAPHQ15003 741 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms