RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SH3GL2Q99962 352 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PDP2Q9P2J9 529 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HEY2Q9UBP5 337 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 IFT172Q9UG01 1749 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C21orf2O43822 256 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM253P0C7T8 217 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 EPC2Q52LR7 807 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KCNN4O15554 427 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SLC1A1P43005 524 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KCNMA1Q12791 1236 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TP53BP2Q13625 1128 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GTF2H3Q13889 308 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NUP93Q8N1F7 819 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 REEP2Q9BRK0 252 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SEPT3Q9UH03 358 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 WEE2P0C1S8 567 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MYBP10242 640 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 IMPDH2P12268 514 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KLRK1P26718 216 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SFNP31947 248 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HERVK_113P62684 666 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CYGBQ8WWM9 190 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA17Q96L03 361 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 AGAP3Q96P47 875 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC7Q99615 494 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NAGPAQ9UK23 515 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 H0YC42 278 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HMOX2P30519 316 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HSD17B4P51659 736 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RAB14P61106 215 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK7Q13164 816 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFB10O96000 172 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RALAP11233 206 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF235Q14590 738 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 POTEAQ6S8J7 498 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CARD9Q9H257 536 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D4O60343 1298 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V1G2O95670 118 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FDX1P10109 184 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KRT78Q8N1N4 520 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf60Q96EN9 201 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RAB21Q9UL25 225 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 AFF2P51816 1311 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms