RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 EVC2Q86UK5 1308 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 MGAT2Q10469 447 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 STRN3Q13033 797 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 MTM1Q13496 603 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 NOMO1Q15155 1222 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 GEN1Q17RS7 908 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
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PTPRC-204ENST00000367379 USP19O94966 1318 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRC-204ENST00000367379 PROK1P58294 105 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 NOMO3P69849 1222 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRC-204ENST00000367379 DISP2A7MBM2 1401 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRC-204ENST00000367379 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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PTPRC-204ENST00000367379 PROM1O43490 865 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 BRINP1O60477 761 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 SRGNP10124 158 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 MTNR1BP49286 362 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 SLC5A3P53794 718 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 CRB1P82279 1406 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 DACT2Q5SW24 774 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRC-204ENST00000367379 UBR7Q8N806 425 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 SARAFQ96BY9 339 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 RNF7Q9UBF6 113 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-204ENST00000367379 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-204ENST00000367379 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.27□□□□□ -1.41
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