RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363613.1

RNU6-1017P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1017, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1017P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 UBR7Q8N806 425 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CXorf38Q8TB03 319 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 STK32AQ8WU08 396 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF558Q96NG5 402 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CASD1Q96PB1 797 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC9A7Q96T83 725 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 YME1L1Q96TA2 773 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ACBD6Q9BR61 282 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DESI2Q9BSY9 194 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MED10Q9BTT4 135 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PLVAPQ9BX97 442 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GPR88Q9GZN0 384 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PARVAQ9NVD7 372 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MIOSQ9NXC5 875 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 INSL6Q9Y581 213 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MYO1FO00160 1098 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NRP1O14786 923 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LPXNO60711 386 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DGKIO75912 1065 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MMEP08473 750 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FGFR1P11362 822 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CSF2RAP15509 400 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GALCP54803 685 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FMO1Q01740 532 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CENPCQ03188 943 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DSC1Q08554 894 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MTF1Q14872 753 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TCEAL1Q15170 157 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 USP41Q3LFD5 358 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ODF2Q5BJF6 829 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF280DQ6N043 979 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GPR65Q8IYL9 337 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FIBCD1Q8N539 461 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RFFLQ8WZ73 363 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C18orf8Q96DM3 657 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMEM169Q96HH4 297 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HSFY1Q96LI6 401 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ARID3AQ99856 593 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SYT15Q9BQS2 421 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SPG21Q9NZD8 308 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EHD2Q9NZN4 543 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AMFRQ9UKV5 643 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 L1RE1Q9UN81 338 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CEP290O15078 2479 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms