RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAMLD1Q13495 774 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DLGAP5Q15398 846 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TBCCQ15814 346 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 WDR44Q5JSH3 913 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SMYD5Q6GMV2 418 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ADGRD1Q6QNK2 874 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SV2AQ7L0J3 742 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 NLRX1Q86UT6 975 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM160B2Q86V87 743 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 AMIGO3Q86WK7 504 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRIM42Q8IWZ5 723 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZFPM1Q8IX07 1006 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 GPD1LQ8N335 351 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF276Q8N554 614 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 BANPQ8N9N5 519 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PYROXD1Q8WU10 500 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 MZB1Q8WU39 189 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 CHURC1Q8WUH1 139 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 UCMAQ8WVF2 138 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 NRG4Q8WWG1 115 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPIRE2Q8WWL2 714 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 APBB2Q92870 758 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 GATA6Q92908 595 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PTPRN2Q92932 1015 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 APOPT1Q96IL0 206 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 OLFM3Q96PB7 478 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PAFAH2Q99487 392 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 GORASP1Q9BQQ3 440 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 CENPKQ9BS16 269 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 MRIQ9BWK5 157 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DEFB129Q9H1M3 183 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 VCX3BQ9H321 246 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PIDD1Q9HB75 910 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 GPAMQ9HCL2 828 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 PARVAQ9NVD7 372 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 KCNK4Q9NYG8 393 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 HEY2Q9UBP5 337 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM198AQ9UFP1 575 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TBX20Q9UMR3 447 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 POLIQ9UNA4 740 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 USTQ9Y2C2 406 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DENND3A2RUS2 1198 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 WDR91A4D1P6 747 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 CFAP69A5D8W1 941 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD56.3-201ENST00000363507 G3V3G9 751 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms