RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 KRBA1A5PL33 1030 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CLIC2O15247 247 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 KLRC4O43908 158 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 HUS1O60921 280 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ECI2O75521 394 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SOAT2O75908 522 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MICAL2O94851 1124 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 NPR3P17342 541 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 AOC1P19801 751 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FCARP24071 287 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 RBP5P82980 135 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TSPY1Q01534 308 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TCF15Q12870 199 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TMC8Q8IU68 726 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 WDR49Q8IV35 697 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 BORCS6Q96GS4 357 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GBP4Q96PP9 640 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 L1RE1Q9UN81 338 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 HPSEQ9Y251 543 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 LAMA1P25391 3075 aa8.24□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MOSPD3O75425 235 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GJA1P17302 382 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ATF6P18850 670 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SYKP43405 635 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CDR1P51861 262 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA8P51970 172 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GPC5P78333 572 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MYL7Q01449 175 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CYP24A1Q07973 514 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCB1Q12824 385 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MYO1EQ12965 1108 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 STK4Q13043 487 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 VEPH1Q14D04 833 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD6Q15008 389 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TEAD2Q15562 447 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ITIH5Q86UX2 942 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FSIP1Q8NA03 581 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 RDH13Q8NBN7 331 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCD2Q92925 531 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PSMG2Q969U7 264 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 HPDLQ96IR7 371 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ASB16Q96NS5 453 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FNBP1Q96RU3 617 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CGRRF1Q99675 332 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC3Q9BY71 257 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ASB3Q9Y575 518 aa8.23□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MYH10P35580 1976 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRU2 124 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PI15O43692 258 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC3O60645 756 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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