RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.03■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 FAM200BP0CF97 657 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 SYTL3Q4VX76 610 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.03■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 TMX2Q9Y320 296 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 IL1R1P14778 569 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 AP2B1P63010 937 aa22.03■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 TASP1Q9H6P5 420 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 PAK5Q9P286 719 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 KIF17Q9P2E2 1029 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 HSD17B3P37058 310 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 NRBF2Q96F24 287 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 FAM107AO95990 144 aa22.02■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 PDK1Q15118 436 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 KYNUQ16719 465 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 IL17RAQ96F46 866 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 KIZQ2M2Z5 673 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 WWP1Q9H0M0 922 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 SENP1Q9P0U3 644 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 NWD1Q149M9 1564 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 AKT1P31749 480 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 TBCCQ15814 346 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 EHD4Q9H223 541 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 AP3B1O00203 1094 aa22.01■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 AKT1S1Q96B36 256 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 ERP44Q9BS26 406 aa22.01■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 CENPCQ03188 943 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 COG4Q9H9E3 785 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 YY1P25490 414 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 RGS2P41220 211 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 TWF1Q12792 350 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 PACSIN1Q9BY11 444 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 IL17RBQ9NRM6 502 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 ACOT1Q86TX2 421 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 FBXL16Q8N461 479 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 MOXD1Q6UVY6 613 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 MPZL3Q6UWV2 235 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 RNF180Q86T96 592 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 PNPLA4P41247 253 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 OGTO15294 1046 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 RBP3P10745 1247 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 ODC1P11926 461 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 STX3Q13277 289 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CDH16O75309 829 aa21.99■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 A0A087X0T9 212 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 M0QYT0 321 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 FAM228BP0C875 321 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 FAXCQ5TGI0 409 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CHSY1Q86X52 802 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 MFN1Q8IWA4 741 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 BHMTQ93088 406 aa21.99■■□□□ 1.11
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