RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346279.3

XAGE3-201, Transcript of X antigen family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XAGE3, Length 497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAGE3-201ENST00000346279 BIN1O00499 593 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SLC16A4O15374 487 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 NCK2O43639 380 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CXCL14O95715 111 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ALDH2P05091 517 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CTSAP10619 480 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 LIG1P18858 919 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PDCP20941 246 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 DDIT3P35638 169 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ZNF131P52739 623 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ZNF124Q15973 351 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 MAPK6Q16659 721 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 AAK1Q2M2I8 961 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 XKR4Q5GH76 650 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 TMC7Q7Z402 723 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CNNM3Q8NE01 707 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 DEPTORQ8TB45 409 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SUSD6Q92537 303 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 RAD54LQ92698 747 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 KCNN1Q92952 543 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 B3GALT6Q96L58 329 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 REEP2Q9BRK0 252 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 RAB34Q9BZG1 259 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CHST7Q9NS84 486 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CITO14578 2027 aa7.33□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PLXNA3P51805 1871 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 N4BP3O15049 544 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SLC26A4O43511 780 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 FAM189A1O60320 539 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 RECQL4O94761 1208 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 BRD1O95696 1058 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PLS3P13797 630 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 EPCAMP16422 314 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PPM1AP35813 382 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 UBA7P41226 1012 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 EFNA5P52803 228 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 NCKAP1LP55160 1127 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 KRT17Q04695 432 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ZP2Q05996 745 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PPP2R5AQ15172 486 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PTPN14Q15678 1187 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SEZ6Q53EL9 994 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 IFT74Q96LB3 600 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 STRA6Q9BX79 667 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PANK2Q9BZ23 570 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CDT1Q9H211 546 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PARP2Q9UGN5 583 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 CD207Q9UJ71 328 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 GDAQ9Y2T3 454 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.31□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.31□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 MYMKA6NI61 221 aa7.31□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 TISP43B9A030 160 aa7.31□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 TECTAO75443 2155 aa7.31□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 BMP15O95972 392 aa7.31□□□□□ -1.24
XAGE3-201ENST00000346279 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms