RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 CDR1P51861 262 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 CYP4F8P98187 520 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 LMNB2Q03252 620 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 WSCD1Q658N2 575 aa25.14■■□□□ 1.62
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TMEM54-201ENST00000329151 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 TTC8Q8TAM2 541 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 NELL1Q92832 810 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 RSPRY1Q96DX4 576 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM54-201ENST00000329151 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.14■■□□□ 1.62
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TMEM54-201ENST00000329151 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.13■■□□□ 1.61
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TMEM54-201ENST00000329151 CHRNB1P11230 501 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 AVPR1AP37288 418 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 STAT6P42226 847 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 SOX9P48436 509 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ALCAMQ13740 583 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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TMEM54-201ENST00000329151 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 NCANO14594 1321 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ARNTLO00327 626 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CTHP32929 405 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGAP8P85298 464 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 BFSP1Q12934 665 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 USP49Q70CQ1 688 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF687Q8N1G0 1237 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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TMEM54-201ENST00000329151 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ATF6P18850 670 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 MYL7Q01449 175 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 SATB1Q01826 763 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 LPAL2Q16609 132 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 SAAL1Q96ER3 474 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 MYMKA6NI61 221 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 KRT19P08727 400 aa25.1■■□□□ 1.61
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TMEM54-201ENST00000329151 PON2Q15165 354 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CLIC6Q96NY7 704 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 PRAMEF12O95522 483 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ITGB3P05106 788 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CSH1P0DML2 217 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CSH2P0DML3 217 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 GARTP22102 1010 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 AMPD2Q01433 879 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CUL4AQ13619 759 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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TMEM54-201ENST00000329151 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM206Q9H813 350 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 DLL3Q9NYJ7 618 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 PPP1R37O75864 691 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 ADSSP30520 456 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CEP68Q76N32 757 aa25.08■■□□□ 1.61
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TMEM54-201ENST00000329151 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 EXOC4Q96A65 974 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 PANK2Q9BZ23 570 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM54-201ENST00000329151 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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