RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHRS4Q9BTZ2 278 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC7A8Q9UHI5 535 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H3BRJ5 948 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDC80O14777 642 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP6V1G1O75348 118 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP1O94782 785 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PROSCO94903 275 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SULT2A1Q06520 285 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SATL1Q86VE3 508 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARMCX1Q9P291 453 aa23.86■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB39O15060 712 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAD21O60216 631 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF862O60290 1169 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHBP35232 272 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPA2P48052 419 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARSEP51690 589 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLC3Q6P597 504 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASSF3Q86WH2 238 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO27Q8NI29 283 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NYXQ9GZU5 481 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LIASO43766 372 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPX6P59796 221 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPS1Q13098 491 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLF2Q8IX21 1173 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXD1Q8NHP7 514 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.411e-13■■■■■ 93.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF536O15090 1300 aa23.85■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TREML1Q86YW5 311 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM11Q96F44 468 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CATSPER2Q96P56 530 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYTH2Q99418 400 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf146Q5VVC0 180 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OGFOD1Q8N543 542 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM206Q9H813 350 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RHBDL2Q9NX52 303 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.84■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0J9YVX5 310 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF76P36508 570 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHDDSQ86SQ9 333 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALLCQ8N6M5 410 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTBPQ96DY7 904 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NACC1Q96RE7 527 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THTPAQ9BU02 230 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 S100A14Q9HCY8 104 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BTG4Q9NY30 223 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.83■■□□□ 1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR6B1O95007 311 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ETV4P43268 484 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SFT2D3Q587I9 215 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PAFAH2Q99487 392 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAGLN3Q9UI15 199 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.83■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA8RI6L899 631 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GAKO14976 1311 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLUHO75153 1309 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HELQQ8TDG4 1101 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.82■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VILLO15195 856 aa23.81■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LPXNO60711 386 aa23.81■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TM4SF1P30408 202 aa23.81■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAS2R40P59535 323 aa23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms