RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTK7Q13308 1070 aa15.45■□□□□ 0.06
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.42■□□□□ 0.06
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PDIK1LQ8N165 341 aa15.42■□□□□ 0.06
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