RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.74■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.74■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.74■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SCINQ9Y6U3 715 aa22.74■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 TRAPPC3O43617 180 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 MGRN1O60291 552 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 DGKDQ16760 1214 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 TFAP2BQ92481 460 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PLVAPQ9BX97 442 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 BATF3Q9NR55 127 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 USTQ9Y2C2 406 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PCNTO95613 3336 aa22.73■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 O00370 1275 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 ITGB3P05106 788 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 FGFR4P22455 802 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 MMP8P22894 467 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PTGIRP43119 386 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SCTRP47872 440 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 E2F5Q15329 346 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 DUPD1Q68J44 220 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PLAAQ9Y263 795 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 GJC1P36383 396 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 HSD17B3P37058 310 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 NAA25Q14CX7 972 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 LRRC45Q96CN5 670 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SETD4Q9NVD3 440 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PARVAQ9NVD7 372 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 GINS2Q9Y248 185 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SNX24Q9Y343 169 aa22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 TSPAN1O60635 241 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 GHRP10912 638 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 CDH8P55286 799 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 ORC1Q13415 861 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 C5orf60A6NFR6 353 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 CD19P15391 556 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 KCNJ1P48048 391 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MESP1-201ENST00000300057 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 MYZAPP0CAP1 466 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 TAS2R40P59535 323 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 GRIK3Q13003 919 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 CYP1B1Q16678 543 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 KIZQ2M2Z5 673 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 KAT6AQ92794 2004 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 FMO2Q99518 471 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SDCBP2Q9H190 292 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.7■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 CALB1P05937 261 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 FSCN2O14926 492 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 PLTPP55058 493 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SNX1Q13596 522 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 SGO2Q562F6 1265 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.69■■□□□ 1.22
MESP1-201ENST00000300057 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms