RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ANO7Q6IWH7 933 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GAREM2Q75VX8 874 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RUFY3Q7L099 469 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 WHAMMQ8TF30 809 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CDT1Q9H211 546 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NCANO14594 1321 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR11A4FU01 709 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN8A6NHC0 703 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YCG3 227 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 AP5Z1O43299 807 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF12O95522 483 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CFIP05156 583 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RPA1P27694 616 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SMTNP53814 917 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAPQ12770 1279 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA3BQ13214 749 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC14A1Q13336 389 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NPY5RQ15761 445 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC36A4Q6YBV0 504 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC30AQ86WT1 665 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FSIP1Q8NA03 581 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNB2Q92953 911 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB34Q9BZG1 259 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ECT2Q9H8V3 914 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP205Q92621 2012 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS20P59510 1910 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PATE3B3GLJ2 98 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN3O15551 220 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TOM1L1O75674 476 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NFATC1O95644 943 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L7P0C7H9 530 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CSH1P0DML2 217 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CSH2P0DML3 217 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 LRPAP1P30533 357 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GJA4P35212 333 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4F8P98187 520 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 STK3Q13188 491 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MTF1Q14872 753 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CRY1Q16526 586 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 EOGTQ5NDL2 527 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP4P1Q86T03 277 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RASSF3Q86WH2 238 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PGBD3Q8N328 593 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP120Q8N960 986 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 BSNDQ8WZ55 320 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TIPINQ9BVW5 301 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HPS4Q9NQG7 708 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.53□□□□□ -1.04
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