RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 BEST2Q8NFU1 509 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 HES6Q96HZ4 224 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 MCEEQ96PE7 176 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 CPXM1Q96SM3 734 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 CNTN3Q9P232 1028 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 PAFAH1B1P43034 410 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 CLCNKBP51801 687 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 MGAT3Q09327 533 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 MYO1EQ12965 1108 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 PTP4A2Q12974 167 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 PAK2Q13177 524 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 MAMLD1Q13495 774 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 ABCB6Q9NP58 842 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.65□□□□□ -0.54
GGPS1-201ENST00000282841 ARL5CA6NH57 179 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 MICAL2O94851 1124 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 MYBL2P10244 700 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC130P13994 396 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 RAB6CQ53S08 254 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 SYNCQ9H7C4 482 aa11.65□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TET1Q8NFU7 2136 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 A8MXQ7 604 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PYGMP11217 842 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 CKBP12277 381 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ADORA2BP29275 332 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 OGDHQ02218 1023 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TAF5Q15542 800 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ERICH1Q86X53 443 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 KPNA7A9QM74 516 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 F8VP50 259 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 MMP8P22894 467 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 FAM81BQ96LP2 452 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 RNF208Q9H0X6 261 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 L1RE1Q9UN81 338 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 MYO1FO00160 1098 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 CLDN5O00501 218 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ERBB2P04626 1255 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 AXLP30530 894 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R40P59535 323 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 LILRA4P59901 499 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF677Q86XU0 584 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 KRIT1O00522 736 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PRLRP16471 622 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 KYAT1Q16773 422 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 WSCD1Q658N2 575 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 USP38Q8NB14 1042 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 PIRO00625 290 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 GPR182O15218 404 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ITGB1P05556 798 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 P4HA1P13674 534 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 ATICP31939 592 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-201ENST00000282841 TUBB2AQ13885 445 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms