RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 ITIH4Q14624 930 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NCAPHQ15003 741 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RAET1EQ8TD07 263 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RAB21Q9UL25 225 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SMIM24O75264 130 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CES1P23141 567 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CDK7P50613 346 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HERVK_113P62684 666 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PORCNQ9H237 461 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ICAM3P32942 547 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MTFR1Q15390 333 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CENPTQ96BT3 561 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EPC1Q9H2F5 836 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM107AO95990 144 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 WEE2P0C1S8 567 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AKR1A1P14550 325 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GRK2P25098 689 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CHRNA5P30532 468 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CDH6P55285 790 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZBTB33Q86T24 672 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LRRC6Q86X45 466 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PYGLP06737 847 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RGS4P49798 205 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ARSEP51690 589 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MAP3K7O43318 606 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SLC37A4O43826 429 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ERCC3P19447 782 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CXCR5P32302 372 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CACNB3P54284 484 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SNAP23O00161 211 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 THP07101 528 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PDGFRAP16234 1089 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ITKQ08881 620 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CHP1Q99653 195 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 A0A0G2JLW4 131 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SH3BP5O60239 455 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 KRT17Q04695 432 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GPS1Q13098 491 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TADA2AO75478 443 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PRAMEP78395 509 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NAA35Q5VZE5 725 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HSFY1Q96LI6 401 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CYP24A1Q07973 514 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NFIAQ12857 509 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PQ67 120 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.62□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 QSOX1O00391 747 aa6.62□□□□□ -1.35
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