RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SHH3Q04487 196 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W TRI1Q05024 226 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W CNL1Q06333 122 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W CSI2Q08054 341 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YCR006CP25350 157 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W IMP1P28627 190 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W SRP14P38985 146 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YER134CP40081 178 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W DFG10P40526 253 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W RPA43P46669 326 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W TNA1P53322 534 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W BOR1P53838 576 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W BOL1Q3E793 110 aa8.76□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YCR007CP25354 239 aa8.75□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W MCH2P36032 473 aa8.75□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W PSD1P39006 500 aa8.75□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YMR166CQ03829 368 aa8.75□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W UPS1Q05776 175 aa8.75□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YPS3Q12303 508 aa8.75□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W UTR5P32630 166 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YBR184WP38299 523 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W PRE5P40302 234 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YDR366CP87287 132 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W SDC1Q03323 175 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W FIT3Q08907 204 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YDL157CQ12082 118 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa8.74□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W SOD1P00445 154 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W PMU1P36069 295 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W XPT1P47165 209 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W HTB1P02293 131 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W HTB2P02294 131 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W CDC26P14724 124 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W MIG1P27705 504 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YIL163CP40448 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W AGE2P40529 298 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YJL028WP47062 111 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YPR098CQ06089 161 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data8.73□□□□□ -1.01not detected
PRP4YPR178W POM34Q12445 299 aa8.73□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W HMRA1P0CY11 126 aa8.72□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W ROX3P25046 220 aa8.72□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W CPD1P53314 239 aa8.72□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W MRL1Q06815 381 aa8.72□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W GEP5Q12393 293 aa8.72□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W COX1P00401 534 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YER190C-BP0CX94 160 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YEL077W-AP0CX95 160 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YGR296C-BP0CX96 160 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YPL283W-BP0CX97 160 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YPR204C-AP0CX98 160 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W PRE1P22141 198 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W QRI5P32344 111 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W PAM17P36147 197 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W TEM1P38987 245 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W UME6P39001 836 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YER188WP40103 239 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W OST1P41543 476 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YJR015WP47090 510 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W DSK2P48510 373 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W MIC27P50945 234 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YNR064CP53750 290 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W WSC2P53832 503 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YDR391CQ04170 232 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YGL258W-AQ3E740 77 aa8.71□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W VPS63O13549 108 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YMR31P19955 123 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W PHD1P36093 366 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W LTP1P40347 161 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W TAF4P50105 388 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W THG1P53215 237 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W NIS1P53939 407 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YPL162CQ12042 273 aa8.7□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W FAB1P34756 2278 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W ERG8P24521 451 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W DYN2Q02647 92 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W ATG21Q02887 496 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RUB1Q03919 77 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W MIX14Q04341 121 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W ECM18Q04623 453 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YOR376WQ08900 122 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YDL180WQ12301 547 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa8.69□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W CUP2P15315 225 aa8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W GSP1P32835 219 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W GSP2P32836 220 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W MTR2P34232 184 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W AIM29P36154 155 aa8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YGL230CP53074 147 aa8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W HSK3P69852 69 aa8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.68□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YPR170W-BP0C5R9 85 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RPS2P25443 254 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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