RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	FMP16	Q12497	93 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RPL39	P04650	51 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SPS100	P13130	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SEC22	P22214	214 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	LDS1	P31379	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	AGA2	P32781	87 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YKL187C	P34231	750 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	PIR5	P46999	287 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	TAD2	P47058	250 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YGR050C	P53231	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	PDR17	P53844	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	STD1	Q02794	444 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YMR082C	Q04276	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SWT1	Q12104	458 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	PHO85	P17157	305 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SRB6	P32570	121 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	TEL1	P38110	2787 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	COX15	P40086	486 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RFC2	P40348	353 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	EMC5	P40540	141 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YHC3	P47040	408 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	FSH2	Q05015	223 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	POS5	Q06892	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RRT7	Q07829	113 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	QCR9	P22289	66 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YKL075C	P36083	450 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YIR020C	P40575	100 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	NCA3	P46955	337 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	WSC2	P53832	503 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	IZH1	Q03419	316 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	COA4	Q05809	96 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	DCS1	Q06151	350 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	GEP5	Q12393	293 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	PMU1	P36069	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	GAT2	P40209	560 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SAS2	P40963	338 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	HXT14	P42833	540 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	EST3	Q03096	181 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	MIX17	Q03667	156 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	COX19	Q3E731	98 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YOS1	Q3E834	85 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SEC59	P20048	519 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	MSK1	P32048	576 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	POG1	P40473	351 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YIL012W	P40551	113 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	ODC1	Q03028	310 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	TMA23	Q03525	211 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	PRR2	Q12310	699 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	COA2	Q3E823	68 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	UPS2	P35200	230 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	MIA40	P36046	403 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YBL071C	P38185	102 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	ICS2	P38284	255 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	CTR2	P38865	189 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	BOR1	P53838	576 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.7	□□□□□ -1.82	not detected
CPR4	YCR069W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YDR114C	Q04597	100 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	CSI2	Q08054	341 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	ATG5	Q12380	294 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	FCY2	P17064	533 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YAR068W	P39564	161 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YJR056C	P47115	236 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	SNN1	P48232	102 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	MIC27	P50945	234 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	YGL262W	P53054	175 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CPR4	YCR069W	HCH1	P53834	153 aa		3.69	□□□□□ -1.82

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