RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	DAL82	P21705	255 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ROX3	P25046	220 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	HMX1	P32339	317 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	TCA17	P32613	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	HSK3	P69852	69 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	LOA1	Q06508	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	STP4	Q07351	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
UBX7	YBR273C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YGL010W	P25338	174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SPS18	P32572	300 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	DER1	P38307	211 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	PIC2	P40035	300 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YER084W	P40057	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SAS2	P40963	338 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	LPP1	Q04396	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ARR3	Q06598	404 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	MCH1	Q07376	486 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SRP21	P32342	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	FPR2	P32472	135 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	MRPS5	P33759	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YKL102C	P34249	101 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	MIA40	P36046	403 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ICS2	P38284	255 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	CUE1	P38428	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YMR262W	P38430	313 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	XPT1	P47165	209 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	MIC27	P50945	234 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	UBC13	P52490	153 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPN14	P53196	417 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	CRH1	P53301	507 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	WSC2	P53832	503 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SAE3	P89114	91 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ECM18	Q04623	453 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	TMA10	Q06177	86 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	NAT3	Q06504	195 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	FIT3	Q08907	204 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPB10	P22139	70 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	REC104	P33323	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YOX1	P34161	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	DAD2	P36162	133 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	HIT1	P46973	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SIP18	P50263	79 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ATG4	P53867	494 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	MHR1	Q06630	226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RAF1	Q06891	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	LDS2	Q08218	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	USV1	Q12132	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	POM33	Q12164	279 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	STE4	P18851	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	DFG10	P40526	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	GLC8	P41818	229 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	YJR015W	P47090	510 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	SHH3	Q04487	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	ARR2	Q06597	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	POM34	Q12445	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX7	YBR273C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	YKL187C	P34231	750 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	MTC6	P38849	526 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	SRP14	P38985	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	YAR068W	P39564	161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	GAT2	P40209	560 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	CNL1	Q06333	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	MRL1	Q06815	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	PAU16	P35994	123 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	PMU1	P36069	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	MIX23	P38162	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	YBR184W	P38299	523 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	YHR173C	P38864	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	UME6	P39001	836 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	UIP3	P39547	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX7	YBR273C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.1 ms