RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641119.1

TNNT3-216, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 BASIC

Gene TNNT3, Length 941 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-216ENST00000641119 PKP1Q13835 747 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SLC44A4Q53GD3 710 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FAM26FQ5R3K3 315 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 RESP18Q5W5W9 173 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 WSCD1Q658N2 575 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ITIH5Q86UX2 942 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TMC8Q8IU68 726 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GLIS3Q8NEA6 775 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DNASE1L2Q92874 299 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 HPS3Q969F9 1004 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PSMG2Q969U7 264 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TMEM209Q96SK2 561 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 C7orf25Q9BPX7 421 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PCIF1Q9H4Z3 704 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TRPV4Q9HBA0 871 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FAM13BQ9NYF5 915 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PCDHA7Q9UN72 937 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.89□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 KANSL1LA0AUZ9 987 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ZNF233A6NK53 670 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FGF19O95750 216 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 HOXD13P35453 343 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 EHHADHQ08426 723 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ANGPT1Q15389 498 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TEAD2Q15562 447 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 UNC13DQ70J99 1090 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TTC9BQ8N6N2 239 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 CXorf38Q8TB03 319 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ZNF507Q8TCN5 953 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FOXQ1Q9C009 403 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 KIAA1586Q9HCI6 787 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PDE11AQ9HCR9 933 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 RCOR1Q9UKL0 485 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 AGAP1Q9UPQ3 857 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 UBE4BO95155 1302 aa12.88□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 A0A1W2PRU2 124 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GFRA3O60609 400 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 HUS1O60921 280 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SOAT2O75908 522 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DCNP07585 359 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TMEM191BP0C7N4 346 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GJA1P17302 382 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PSMC3P17980 439 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 RBP5P82980 135 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 VEPH1Q14D04 833 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SURF1Q15526 300 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PDCL2Q8N4E4 241 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SPATA18Q8TC71 538 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SPPL2BQ8TCT7 592 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 E2F7Q96AV8 911 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 MTMR12Q9C0I1 747 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 BRD9Q9H8M2 597 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 HSPBP1Q9NZL4 362 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 MIA3Q5JRA6 1907 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 CFAP54Q96N23 3096 aa12.87□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 COL4A3Q01955 1670 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TGFB1I1O43294 461 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 ATF6P18850 670 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 VIPR2P41587 438 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 TSPY1Q01534 308 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 BFSP1Q12934 665 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GRM2Q14416 872 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 DUOXA2Q1HG44 320 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 MGAT5BQ3V5L5 792 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 VITQ6UXI7 678 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 GAREM2Q75VX8 874 aa12.86□□□□□ -0.35
TNNT3-216ENST00000641119 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms