RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPR3	P17342	541 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	CMA1	P23946	247 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP2J2	P51589	502 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBP5	P82980	135 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SURF1	Q15526	300 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	LEMD2	Q8NC56	503 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	BORCS6	Q96GS4	357 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	HUS1	O60921	280 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCR2	P41597	374 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUBP1	P53384	320 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	BECN1	Q14457	450 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	PAGE5	Q96GU1	130 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	EXOC1	Q9NV70	894 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SOAT2	O75908	522 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	GJA1	P17302	382 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	AOC1	P19801	751 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCF15	Q12870	199 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	INTS13	Q9NVM9	706 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	TGFB1I1	O43294	461 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	PI15	O43692	258 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	MICAL2	O94851	1124 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	EHHADH	Q08426	723 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP25	Q9UHP3	1055 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCN1A	P35498	2009 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	ECI2	O75521	394 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSPY1	Q01534	308 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYO1E	Q12965	1108 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	FNBP1	Q96RU3	617 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOTCH4	Q99466	2003 aa		31.2	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029		H0Y858	1186 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SYK	P43405	635 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PFKP	Q01813	784 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	VEPH1	Q14D04	833 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TAF12	Q16514	161 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITIH5	Q86UX2	942 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIX4	Q9UIU6	781 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	L1RE1	Q9UN81	338 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ASB3	Q9Y575	518 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRJ	Q12913	1337 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNNI1	P19237	187 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPHA5	P54756	1037 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMARCB1	Q12824	385 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TEAD2	Q15562	447 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	POTEH	Q6S545	545 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	WDR49	Q8IV35	697 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SHD	Q96IW2	340 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A1W2PRU2	124 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYL7	Q01449	175 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	CXorf38	Q8TB03	319 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58

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