RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SLC37A4O43826 429 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 PPP3CCP48454 512 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SNX31Q8N9S9 440 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA18Q8TC71 538 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB9P50453 376 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 KRT72Q14CN4 511 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 GMCL1Q96IK5 515 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 CD274Q9NZQ7 290 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SNX12Q9UMY4 172 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 ITIH2P19823 946 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.1■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 TAGAPQ8N103 731 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 C5orf58C9J3I9 102 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 PDHXO00330 501 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 CHUKO15111 745 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO32Q969P5 355 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 TRABDQ9H4I3 376 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 PXMP2Q9NR77 195 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RSPH10BP0C881 870 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SLC26A2P50443 739 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SEZ6Q53EL9 994 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.09■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SNX5Q9Y5X3 404 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.09■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 EPHB2P29323 1055 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 DDIT4Q9NX09 232 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 F5H5T6 163 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 ANGPT2O15123 496 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8RI6L899 631 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 ARP10275 920 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 TROAPQ12815 778 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.08■□□□□ 0.97
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CTDP1-208ENST00000613122 TASP1Q9H6P5 420 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.08■□□□□ 0.97
CTDP1-208ENST00000613122 COMTP21964 271 aa21.08■□□□□ 0.96
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