RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF169	Q8NCN4	708 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	LPP	Q93052	612 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RILPL2	Q969X0	211 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MPP4	Q96JB8	637 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	IL23A	Q9NPF7	189 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	UBE2QL1	A1L167	161 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	SH3D21	A4FU49	640 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CLCA1	A8K7I4	914 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB27B	O00194	218 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RFXAP	O00287	272 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	FFAR3	O14843	346 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM13	O60858	407 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	HAUS5	O94927	633 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	AGFG2	O95081	481 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFAIP3	P21580	790 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	BDNF	P23560	247 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	KLRC1	P26715	233 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GABRB3	P28472	473 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PTTG1IP	P53801	180 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	NPEPPS	P55786	919 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PTH1R	Q03431	593 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CFHR4	Q92496	578 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	NTM	Q9P121	344 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF69	Q9UC07	566 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PRRT4	C9JH25	899 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608		E9PLN8	166 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MYO1C	O00159	1063 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	EYA2	O00167	538 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ASNA1	O43681	348 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	VPS4B	O75351	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RHOBTB3	O94955	611 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	INHBB	P09529	407 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CNTF	P26441	200 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	USP37	Q86T82	979 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	SPSB4	Q96A44	273 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	NELL2	Q99435	816 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR35	Q9HC97	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GGA3	Q9NZ52	723 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	XPR1	Q9UBH6	696 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608		H7C4K7	107 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MATN2	O00339	956 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	AREL1	O15033	823 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PRSS23	O95084	383 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	A1BG	P04217	495 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ITGB1	P05556	798 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	POLB	P06746	335 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CKMT1A	P12532	417 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GYS1	P13807	737 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CHRM3	P20309	590 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	IL1R2	P27930	398 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48

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