RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 PRLRP16471 622 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CAPN2P17655 700 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PAX3P23760 479 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.175e-7■■□□□ 12
EFTUD2-214ENST00000589769 SCNN1GP51170 649 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 NDST1P52848 882 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PTP4A2Q12974 167 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 GPNMBQ14956 572 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 NAA35Q5VZE5 725 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 APBB2Q92870 758 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TLR10Q9BXR5 811 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 LHX5Q9H2C1 402 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SNX12Q9UMY4 172 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 COG5Q9UP83 839 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MYH10P35580 1976 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 LTBP2Q14767 1821 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 O00370 1275 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CTIFO43310 598 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CXCL10P02778 98 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 VDRP11473 427 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MMP8P22894 467 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 GJA8P48165 433 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 LILRA4P59901 499 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 STILQ15468 1287 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF394Q53GI3 561 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 DPH6Q7L8W6 267 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 UROC1Q96N76 676 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MMS19Q96T76 1030 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCB6Q9NP58 842 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PODXLO00592 558 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 ENC1O14682 589 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CAPN15O75808 1086 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TUSC3Q13454 348 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SPATA18Q8TC71 538 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 RNF19AQ9NV58 838 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MIOSQ9NXC5 875 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TBX21Q9UL17 535 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 L1RE1Q9UN81 338 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP83Q9Y592 693 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 NME7Q9Y5B8 376 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP350Q5VT06 3117 aa16.12■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SCN5AQ14524 2016 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CES2O00748 559 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CALB1P05937 261 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CD19P15391 556 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 FAAP100Q0VG06 881 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CNGA2Q16280 664 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM60Q495X7 471 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SGO2Q562F6 1265 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 PASD1Q8IV76 773 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 SEPT8Q92599 483 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-214ENST00000589769 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms