RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MTERF2Q49AM1 385 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SV2AQ7L0J3 742 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MAATS1Q7Z4T9 603 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 PPM1KQ8N3J5 372 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP8B4Q8TF62 1192 aa27.14■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 THAP2Q9H0W7 228 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 UVRAGQ9P2Y5 699 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6BA6NDN3 693 aa27.14■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 NME8Q8N427 588 aa27.14■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 AP3M2P53677 418 aa27.13■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.13■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC20A1Q8WUM9 679 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF26Q96DR7 871 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 RAD51CO43502 376 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 M0QZ92 97 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 AGPSO00116 658 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP26A1O43174 497 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 SART1O43290 800 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 MYBL1P10243 752 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 DNA2P51530 1060 aa27.09■■□□□ 1.93
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