RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580976.1

RHOT1-208, Transcript of ras homolog family member T1, human

TSL 4

Gene RHOT1, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT1-208	ENST00000580976	AMY1A	P04745	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CYP2C8	P10632	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	AKR1B1	P15121	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ALOX12	P18054	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	HOXC13	P31276	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	NPTX2	P47972	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ITGA1	P56199	1179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	NKX3-2	P78367	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	GRM1	Q13255	1194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SSPN	Q14714	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	BTN3A1	O00481	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PTP4A3	O75365	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MTA2	O94776	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	INMT	O95050	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	DNTT	P04053	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PRKCB	P05771	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CSF1	P09603	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PFKL	P17858	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TGM1	P22735	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PTGS1	P23219	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TXK	P42681	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	COPA	P53621	1224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	KRT32	Q14532	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	STIL	Q15468	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SNX27	Q96L92	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976		H7C0S8	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	F2RL2	O00254	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	P4HA2	O15460	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	PHF2	O75151	1096 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	IL18BP	O95998	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	NPPB	P16860	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SYN1	P17600	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	HDC	P19113	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	IL11	P20809	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	NRG3	P56975	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	ACTR2	P61160	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	CUL4B	Q13620	913 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SURF1	Q15526	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	BAK1	Q16611	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOT1-208	ENST00000580976	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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