RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580103.6

NSRP1-208, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-208	ENST00000580103	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	KIF3A	Q9Y496	699 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103		A0A1W2PRU2	124 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103		K7ENM7	598 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	SNPH	O15079	494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	CHAD	O15335	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	NCAM2	O15394	837 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	SOAT2	O75908	522 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	WEE1	P30291	646 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ADSS	P30520	456 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	WNT7B	P56706	349 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PTPA	Q15257	358 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ELMOD1	Q8N336	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM3C	Q92520	227 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PSMG2	Q969U7	264 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	BICD1	Q96G01	975 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	DERA	Q9Y315	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ASB3	Q9Y575	518 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103		H3BQV1	296 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ZNF263	O14978	683 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM13A	O94988	1023 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ATF6	P18850	670 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PAX3	P23760	479 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	DDIT3	P35638	169 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	UBA7	P41226	1012 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ACOT2	P49753	483 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	EPHB3	P54753	998 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PLD1	Q13393	1074 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	CUL4A	Q13619	759 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68	6e-9	■■□□□ 14
NSRP1-208	ENST00000580103	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	CALML4	Q96GE6	196 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	EPSTI1	Q96J88	318 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	IER2	Q9BTL4	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	ASB7	Q9H672	318 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NSRP1-208	ENST00000580103	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103		K7ESF4	209 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	PRAMEF12	O95522	483 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	ODC1	P11926	461 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	CCNE1	P24864	410 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	HOXC13	P31276	330 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	SOX9	P48436	509 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	SATB1	Q01826	763 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	DMWD	Q09019	674 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	KCNA1	Q09470	495 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	BRAP	Q7Z569	592 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	USP37	Q86T82	979 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	CHFR	Q96EP1	664 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	CLIC4	Q9Y696	253 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	FRY	Q5TBA9	3013 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NSRP1-208	ENST00000580103	MYMK	A6NI61	221 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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