RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 GPD1LQ8N335 351 aa24.24■■□□□ 1.47
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CLN3-215ENST00000565236 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.24■■□□□ 1.47
CLN3-215ENST00000565236 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.24■■□□□ 1.47
CLN3-215ENST00000565236 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.24■■□□□ 1.47
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CLN3-215ENST00000565236 CFAP45Q9UL16 551 aa24.23■■□□□ 1.47
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CLN3-215ENST00000565236 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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CLN3-215ENST00000565236 A0A1W2PRU2 124 aa24.21■■□□□ 1.47
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CLN3-215ENST00000565236 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CLN3-215ENST00000565236 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.19■■□□□ 1.46
CLN3-215ENST00000565236 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.19■■□□□ 1.46
CLN3-215ENST00000565236 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CLN3-215ENST00000565236 GABRR2P28476 465 aa24.18■■□□□ 1.46
CLN3-215ENST00000565236 GDI1P31150 447 aa24.18■■□□□ 1.46
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