RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	REPS1	Q96D71	796 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PPEF2	O14830	753 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	JTB	O76095	146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TRIAP1	O43715	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CLSTN1	O94985	981 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	JUP	P14923	745 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	NDUFB7	P17568	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CCKBR	P32239	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF213	O14771	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ANXA1	P04083	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TUBB4A	P04350	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CBSL	P0DN79	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CBS	P35520	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ERVK-21	P61565	698 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TBCC	Q15814	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SGTA	O43765	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	NXPH3	O95157	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	EYA4	O95677	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	MMP13	P45452	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TLE1	Q04724	770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	RAB39A	Q14964	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	VPS16	Q9H269	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	GPR39	O43194	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	NR4A2	P43354	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843		H0YIZ8	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	MYO1F	O00160	1098 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	IL10RA	Q13651	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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