RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	OR14I1	A6ND48	311 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ARVCF	O00192	962 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DLX3	O60479	287 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	JAK2	O60674	1132 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KPNA6	O60684	536 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CABYR	O75952	493 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF286B	P0CG31	522 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	AR	P10275	920 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TGFB3	P10600	412 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FGFR1	P11362	822 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TACR1	P25103	407 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	RCAN1	P53805	252 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	EVC	P57679	992 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CORO7	P57737	925 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP4K2	Q12851	820 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MTMR1	Q13613	665 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	NEDD9	Q14511	834 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	RABEP1	Q15276	862 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKD	Q16760	1214 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR16	Q569H4	304 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	USP53	Q70EK8	1073 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DPH6	Q7L8W6	267 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXL16	Q8N461	479 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MORC4	Q8TE76	937 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	USP33	Q8TEY7	942 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GLG1	Q92896	1179 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC6	Q99741	560 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MAF1	Q9H063	256 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNK12	Q9HB15	430 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288		Q9Y3F1	56 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIP11	Q15643	1979 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BQV1	296 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ARNTL	O00327	626 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FIBP	O43427	364 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP9A	O75110	1047 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PPFIA4	O75335	1185 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	STAM2	O75886	525 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CTDNEP1	O95476	244 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MPO	P05164	745 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP3	P08254	477 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CLTB	P09497	229 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	COL6A1	P12109	1028 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	EDNRB	P24530	442 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MARK3	P27448	753 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT2	P35908	639 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LTBR	P36941	435 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL23	P55773	120 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	IGBP1	P78318	339 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP1	Q07960	439 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGIS	Q16647	500 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	INF2	Q27J81	1249 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LETM2	Q2VYF4	491 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MBLAC2	Q68D91	279 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC103	Q8IW40	242 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LZTR1	Q8N653	840 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCK	Q8TEA7	893 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	BAD	Q92934	168 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf159	Q96HA4	380 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CDHR1	Q96JP9	859 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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