RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CLIC6	Q96NY7	704 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TMEM209	Q96SK2	561 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TASP1	Q9H6P5	420 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	POLD4	Q9HCU8	107 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KCND2	Q9NZV8	630 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZNF292	O60281	2723 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TTC26	A0AVF1	554 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LAD1	O00515	517 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	AXIN1	O15169	862 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SLC16A4	O15374	487 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EPN2	O95208	641 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CCDC192	P0DO97	292 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ODC1	P11926	461 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PLS3	P13797	630 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GABRR2	P28476	465 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CDC25C	P30307	473 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SOX9	P48436	509 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	VEPH1	Q14D04	833 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PON2	Q15165	354 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	STK38	Q15208	465 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ECM1	Q16610	540 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	FBXO43	Q4G163	708 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GPR158	Q5T848	1215 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	STPG1	Q5TH74	334 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688		Q6ZS52	159 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GAREM2	Q75VX8	874 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CD302	Q8IX05	232 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DAW1	Q8N136	415 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KCNN1	Q92952	543 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GCNA	Q96QF7	691 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	VPS45	Q9NRW7	570 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DSE	Q9UL01	958 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NOTCH4	Q99466	2003 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MTMR11	A4FU01	709 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688		E9PMD0	336 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EXTL3	O43909	919 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RHOBTB1	O94844	696 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KCNK5	O95279	499 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	VNN2	O95498	520 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ADRB2	P07550	413 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	OR4Q2	P0C623	313 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22	5e-8	■■■■■ 43.3
CS-233	ENST00000552688	PRPH	P41219	470 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MAPK7	Q13164	816 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RUNX3	Q13761	415 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TAF12	Q16514	161 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	USP49	Q70CQ1	688 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KBTBD6	Q86V97	674 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C11orf74	Q86VG3	221 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KIF12	Q96FN5	646 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		7.42	□□□□□ -1.22

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