RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-224ENST00000550446 CHADO15335 359 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 LILRB5O75023 590 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 GABRR2P28476 465 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 GPR158Q5T848 1215 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ITIH5Q86UX2 942 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 DSEQ9UL01 958 aa20.5■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ARNTLO00327 626 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FGF19O95750 216 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CYP11A1P05108 521 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CHRNB1P11230 501 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SOX9P48436 509 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 NRLP54845 237 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 PPP2R5DQ14738 602 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SFR1Q86XK3 245 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 GIPC2Q8TF65 315 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 EPC1Q9H2F5 836 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 C2CD2Q9Y426 696 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.49■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 TAF6P49848 677 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 VEPH1Q14D04 833 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 TAF12Q16514 161 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 WSCD1Q658N2 575 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.48■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ADSSP30520 456 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CXCL12P48061 93 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CCR3P51677 355 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CYP4F8P98187 520 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 POSTNQ15063 836 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 PTPAQ15257 358 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 CLIC6Q96NY7 704 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 IER2Q9BTL4 223 aa20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MYMKA6NI61 221 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 KPNA7A9QM74 516 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 TDGF1P13385 188 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ATF6P18850 670 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SATB1Q01826 763 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 KCNA1Q09470 495 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 GAS6Q14393 721 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 LPAL2Q16609 132 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 SV2BQ7L1I2 683 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 PANK2Q9BZ23 570 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 TASP1Q9H6P5 420 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 STK17AQ9UEE5 414 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.46■□□□□ 0.87
LETMD1-224ENST00000550446 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 IL18RAPO95256 599 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 PDCP20941 246 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 LRRC32Q14392 662 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 HVCN1Q96D96 273 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 MSANTD3Q96H12 275 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 GCNAQ96QF7 691 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 ACCSQ96QU6 501 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LETMD1-224ENST00000550446 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms