RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549007.1

APAF1-208, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 3,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APAF1-208	ENST00000549007	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	AHSG	P02765	367 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	HRG	P04196	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SLC6A9	P48067	706 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CD83	Q01151	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.36	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TSHR	P16473	764 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	STAT5B	P51692	787 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	HERVK_113	P62684	666 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	NOG	Q13253	232 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ACAP1	Q15027	740 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TAF5	Q15542	800 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LPIN2	Q92539	896 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	FOXB1	Q99853	325 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007		A0A087WV62	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	PYGL	P06737	847 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	MYF5	P13349	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	FPR1	P21462	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SLC7A1	P30825	629 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	RTP5	Q14D33	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	EYA3	Q99504	573 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	PSMD14	O00487	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CHGB	P05060	677 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CXCL9	Q07325	125 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.34	□□□□□ -1.71
APAF1-208	ENST00000549007	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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