RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548211.1

RPAP3-205, Transcript of RNA polymerase II associated protein 3, human

TSL 2

Gene RPAP3, Length 555 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPAP3-205	ENST00000548211	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	KIF14	Q15058	1648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	GPD1	P21695	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ITPKB	P27987	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	FAP	Q12884	760 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CLIP1	P30622	1438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	AOX1	Q06278	1338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	PPP3CB	P16298	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CELA2A	P08217	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	PTPRR	Q15256	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CLUL1	Q15846	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TOR1B	O14657	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ITGB6	P18564	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	WAS	P42768	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	IL10RA	Q13651	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	JADE3	Q92613	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SYNM	O15061	1565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211		E9PLN8	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	NDUFS2	O75306	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC43A1	O75387	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CD1A	P06126	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	RHO	P08100	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	C5AR1	P21730	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	HSD3B2	P26439	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CNGA1	P29973	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	TFF2	Q03403	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPAP3-205	ENST00000548211	SNX19	Q92543	992 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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