RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.09□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIP11Q15643 1979 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HAS3O00219 553 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STX10O60499 249 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAMTS4O75173 837 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERLIN2O94905 339 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRKCBP05771 671 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEFHP12036 1026 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAPN2P17655 700 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GARTP22102 1010 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTGS1P23219 599 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNA15P30679 374 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GJA8P48165 433 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASP5P51878 434 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBXN1Q04323 297 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CETN1Q12798 172 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAPSQ13938 189 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAN2A1Q16706 1144 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KAT2BQ92831 832 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP89Q96ST8 783 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF208Q9H0X6 261 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VPS16Q9H269 839 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087WZ62 844 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYADML2A6NDP7 307 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLDN3O15551 220 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VTNP04004 478 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC172P0C7W6 258 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP1A3P13637 1013 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF18P17022 549 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACLYP53396 1101 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTENP60484 403 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGA7Q13683 1181 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRT31Q15323 416 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SURF1Q15526 300 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KYAT1Q16773 422 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMC6Q7Z403 805 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KSR1Q8IVT5 923 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BSNDQ8WZ55 320 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IQCDQ96DY2 449 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRELD1Q96HD1 420 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FIZ1Q96SL8 496 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STRA6Q9BX79 667 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PBX4Q9BYU1 374 aa6.08□□□□□ -1.44
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.08□□□□□ -1.44
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