RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EXOC1Q9NV70 894 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ITM2BQ9Y287 266 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GUL7 405 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FAM25EA8MYX2 175 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 KCNJ6P48051 423 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CCNA1P78396 465 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TEX11Q8IYF3 940 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CCDC89Q8N998 374 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CENPTQ96BT3 561 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 C12orf42Q96LP6 360 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SH3GL3Q99963 347 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TINF2Q9BSI4 451 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 KBTBD13C9JR72 458 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 KRT38O76015 456 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 GJB6O95452 261 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FGAP02671 866 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ITGB8P26012 769 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PIK3CAP42336 1068 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 LSAMPQ13449 338 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 LBX2Q6XYB7 198 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SPATA5Q8NB90 893 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 VMP1Q96GC9 406 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PIEZO1Q92508 2521 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FLT1P17948 1338 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PLATP00750 562 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ZNF28P17035 718 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EPHB4P54760 987 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ANO1Q5XXA6 986 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MAP3K14Q99558 947 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EPN3Q9H201 632 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 BTBD7Q9P203 1132 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 F8VZ95 297 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 SEPT4O43236 478 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 TADA3O75528 432 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 UQCRHP07919 91 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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LMO3-212ENST00000535535 GRIA2P42262 883 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 MRE11P49959 708 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 NKX3-2P78367 333 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 TLE2Q04725 743 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 SEPT2Q15019 361 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 STEAP3Q658P3 488 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 PPM1EQ8WY54 764 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 FAM122AQ96E09 287 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 CDIP1Q9H305 208 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-212ENST00000535535 DTLQ9NZJ0 730 aa8.64□□□□□ -1.03
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