RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 JCADQ9P266 1359 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 C5P01031 1676 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC4O15439 1325 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LRP6O75581 1613 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 NRP2O60462 931 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 HOXB7P09629 217 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TYRP1P17643 537 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DL3P43628 341 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GPSM2P81274 684 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LONRF1Q17RB8 773 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SPRED1Q7Z699 444 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ERP27Q96DN0 273 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TNIP3Q96KP6 325 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 IL23AQ9NPF7 189 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 POLG2Q9UHN1 485 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 EP400Q96L91 3159 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2QL1A1L167 161 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 GPR15P49685 360 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TERF1P54274 439 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 NRG3P56975 720 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GTF2H3Q13889 308 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 LMBR1LQ6UX01 489 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZSN1 163 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CPA6Q8N4T0 437 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TTC17Q96AE7 1141 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CAPN14A8MX76 684 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 F5H423 210 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 AGR2O95994 175 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SETSIPP0DME0 302 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 CYP2C19P33261 490 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ADAM8P78325 824 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 HYIQ5T013 277 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 PRSS50Q9UI38 385 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KCPQ6ZWJ8 1503 aa4.85□□□□□ -1.63
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