RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 NR2F6P10588 404 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 DRD4P21917 467 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CYP2C19P33261 490 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CCT8P50990 548 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 GRM1Q13255 1194 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF425Q6IV72 752 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 RFKQ969G6 155 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 COA7Q96BR5 231 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 BRD9Q9H8M2 597 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 EHD3Q9NZN3 535 aa6.39□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF785A8K8V0 405 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 F2RL2O00254 374 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SOAT2O75908 522 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CHEK2O96017 543 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 EBLN1P0CF75 366 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 MYBL2P10244 700 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 MALP21145 153 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 KRT85P78386 507 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TTC7BQ86TV6 843 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 FKBP10Q96AY3 582 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TEKT5Q96M29 485 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.38□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PROB1E7EW31 1015 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA12O60330 932 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 GJB1P08034 283 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SIK2Q9H0K1 926 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ETAA1Q9NY74 926 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.37□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ITGALP20701 1170 aa6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TFF2Q03403 129 aa6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SNAPC2Q13487 334 aa6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF366Q8N895 744 aa6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ABCC9O60706 1549 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SHTN1A0MZ66 631 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TARM1B6A8C7 271 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 NXPH3O95157 252 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SMARCA1P28370 1054 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 BMPR2Q13873 1038 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 MTX3Q5HYI7 312 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 GPR35Q9HC97 309 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.35□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 PRR35P0CG20 571 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 NDUFB7P17568 137 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CD6P30203 668 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 TBCCQ15814 346 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 CEP85Q6P2H3 762 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 FAM136AQ96C01 138 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.34□□□□□ -1.39
SGCE-211ENST00000522045 RARBP10826 455 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 CTGFP29279 349 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PIK3CGP48736 1102 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
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