RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TECP42680 631 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 KRT76Q01546 638 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SLC34A1Q06495 639 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PPP2R5CQ13362 524 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 IQSEC1Q6DN90 963 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD5Q6N075 450 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CYFIP1Q7L576 1253 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TNS4Q8IZW8 715 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 NAT14Q8WUY8 206 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GPRASP2Q96D09 838 aa10.67□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GINS2Q9Y248 185 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC166P0CW27 439 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 KRT13P13646 458 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CYP11B2P19099 503 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINB3P29508 390 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CPT1AP50416 773 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 YARSP54577 528 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 PGM5Q15124 567 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 FAM20AQ96MK3 541 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB118Q96PH6 123 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 INIPQ9NRY2 104 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 NAGPAQ9UK23 515 aa10.66□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DYMQ7RTS9 669 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP18Q8N392 663 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 HES6Q96HZ4 224 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GABRQQ9UN88 632 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 VAV1P15498 845 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CDK7P50613 346 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 HPCAP84074 193 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 AMPD3Q01432 767 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TMED1Q13445 227 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ASIC2Q16515 512 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PCNX4Q63HM2 1172 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM109Q9BVC6 243 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF35A5YM69 484 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 WDR64B1ANS9 1081 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5HO75947 161 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TDP2O95551 362 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TGFB3P10600 412 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 GRB14Q14449 540 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 SATL1Q86VE3 508 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MAP3K7O43318 606 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PSMG1O95456 288 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 EYA4O95677 639 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GALK1P51570 392 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 JAK3P52333 1124 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CDR2Q01850 454 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DAGLBQ8NCG7 672 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEB18Q96M61 343 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN15O75808 1086 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LMNAP02545 664 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 CYP4A11Q02928 519 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MOGSQ13724 837 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 TTC27Q6P3X3 843 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 C7orf31Q8N865 590 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CORO1BQ9BR76 489 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CENPKQ9BS16 269 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 KCNH7Q9NS40 1196 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DNM3Q9UQ16 869 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.65□□□□□ -0.7
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