RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 USP25Q9UHP3 1055 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GGT7Q9UJ14 662 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 LCTP09848 1927 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0B4J269 797 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT5P13647 590 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ALDH1A3P47895 512 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NCKAP1LP55160 1127 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TBX4P57082 545 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM189BP81408 668 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RBP5P82980 135 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GTF2BQ00403 316 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 POU5F1BQ06416 359 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP4Q13115 394 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF699Q32M78 642 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RETREG3Q86VR2 466 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CWH43Q9H720 699 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 EXTL3O43909 919 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 C8AP07357 584 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 IL9P15248 144 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCD1P33897 745 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF560Q96MR9 790 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PLVAPQ9BX97 442 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CFHP08603 1231 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GRIK1P39086 918 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CDH8P55286 799 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NTHL1P78549 312 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC8Q8TAM2 541 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ST7Q9NRC1 585 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CD207Q9UJ71 328 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KPNA7A9QM74 516 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SOD2P04179 222 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ODC1P11926 461 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ADSSP30520 456 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RAP1GAPP47736 663 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MYL7Q01449 175 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 VEPH1Q14D04 833 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SGSM3Q96HU1 749 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SNX27Q96L92 541 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ASGR2P07307 311 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ADORA2BP29275 332 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MYL6P60660 151 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MCL1Q07820 350 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HYAL1Q12794 435 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PAK1Q13153 545 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KYAT1Q16773 422 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAM32Q8TC27 787 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CTSAP10619 480 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 P4HA1P13674 534 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MXI1P50539 228 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 VAMP7P51809 220 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RAPGEF1Q13905 1077 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SV2CQ496J9 727 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms