RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RAB34Q9BZG1 259 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ACAD9Q9H845 621 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RNF146Q9NTX7 359 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PFASO15067 1338 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCDC66A2RUB6 948 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SGPL1O95470 568 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HPXP02790 462 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MCM7P33993 719 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 KIF22Q14807 665 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ZNF174Q15697 407 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NPY5RQ15761 445 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MROH9Q5TGP6 573 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LILRA2Q8N149 483 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LZTR1Q8N653 840 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RAET1EQ8TD07 263 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GUCD1Q96NT3 240 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ANO3Q9BYT9 981 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MROH8Q9H579 483 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CLIC4Q9Y696 253 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MYO9BQ13459 2157 aa8.15□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ZNF536O15090 1300 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 C22orf46C9J442 243 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CBX4O00257 560 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MEIS2O14770 477 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 NEMFO60524 1076 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CUTAO60888 179 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ADAM23O75077 832 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 EYA4O95677 639 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FUCA1P04066 466 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PYGMP11217 842 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SYN1P17600 705 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SREBF1P36956 1147 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SCNN1BP51168 640 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 HSD17B4P51659 736 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 KCTD2Q14681 263 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SNX17Q15036 470 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PLCL1Q15111 1095 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CRY1Q16526 586 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TMEM177Q53S58 311 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 WDR78Q5VTH9 848 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ADALQ6DHV7 355 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 REPS2Q8NFH8 660 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 NCOR1O75376 2440 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 NOTOA8MTQ0 251 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 STRNO43815 780 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 BRINP1O60477 761 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 STAM2O75886 525 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CYP3A4P08684 503 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FCER1AP12319 257 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FPR2P25090 351 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PMLP29590 882 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CCND2P30279 289 aa8.13□□□□□ -1.11
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