RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 TMX1Q9H3N1 280 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 RSAD1Q9HA92 442 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SNTG2Q9NY99 539 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GCNT4Q9P109 453 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CNTN3Q9P232 1028 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PARP2Q9UGN5 583 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SCN5AQ14524 2016 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ANK1P16157 1881 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PQC6 194 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 EFSO43281 561 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 AMHP03971 560 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM49P0CI25 452 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM49CP0CI26 452 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CDC25BP30305 580 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TNFSF9P41273 254 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PIK3CAP42336 1068 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 KCNJ6P48051 423 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FMO5P49326 533 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SEZ6Q53EL9 994 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 RNF169Q8NCN4 708 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 BEST2Q8NFU1 509 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DPF3Q92784 378 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 BORCS6Q96GS4 357 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FAM81BQ96LP2 452 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IL23AQ9NPF7 189 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 BRD7Q9NPI1 651 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TTC26A0AVF1 554 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 C9IYK1 514 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PMM2O15305 246 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MGEA5O60502 916 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PHACTR2O75167 634 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CSF2RAP15509 400 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 EPB42P16452 691 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MLH1P40692 756 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF75DP51815 510 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GRIK3Q13003 919 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MIIPQ5JXC2 388 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GBP6Q6ZN66 633 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FMNL3Q8IVF7 1028 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FBXL13Q8NEE6 735 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF560Q96MR9 790 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 NDFIP2Q9NV92 336 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 INTS13Q9NVM9 706 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 HES2Q9Y543 173 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 KCNMB2Q9Y691 235 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ITIH6Q6UXX5 1313 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 ADCY5O95622 1261 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 NFICP08651 508 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 P4HA1P13674 534 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 KCNE1P15382 129 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 PCSK2P16519 638 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 AKAP5P24588 427 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 GCLMP48507 274 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 TRPC3Q13507 836 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 SLC10A6Q3KNW5 377 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 JADE1Q6IE81 842 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 DRC7Q8IY82 874 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC43Q8N309 656 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-211ENST00000497210 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
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