RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495517.5

RBM41-208, Transcript of RNA binding motif protein 41, human

TSL 2

Gene RBM41, Length 3,315 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM41-208	ENST00000495517	SELP	P16109	830 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TNFRSF8	P28908	595 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	DLG4	P78352	724 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RBP5	P82980	135 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NR1H3	Q13133	447 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	LRRC38	Q5VT99	294 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF560	Q96MR9	790 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ACAP3	Q96P50	834 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CCDC169	A6NNP5	214 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF263	O14978	683 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TREH	O43280	583 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CP	P00450	1065 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ASIC2	Q16515	512 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RNF34	Q969K3	372 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	VWCE	Q96DN2	955 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SGSM3	Q96HU1	749 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	MIS12	Q9H081	205 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	L1RE1	Q9UN81	338 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SCN1A	P35498	2009 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TBC1D4	O60343	1298 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	HLA-DRA	P01903	254 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TUBB	P07437	444 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CKB	P12277	381 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	MPST	P25325	297 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	MTA1	Q13330	715 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RAET1E	Q8TD07	263 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CD101	Q93033	1021 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SETD4	Q9NVD3	440 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CCDC151	A5D8V7	595 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SORBS3	O60504	671 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TNNC2	P02585	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CLCN3	P51790	818 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KIF11	P52732	1056 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	MON1B	Q7L1V2	547 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	VPS36	Q86VN1	386 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SLCO2A1	Q92959	643 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	AGPAT1	Q99943	283 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	COL4A2	P08572	1712 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KBTBD13	C9JR72	458 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517		M0QZ92	97 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	MYL3	P08590	195 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PFKL	P17858	780 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SLC9A1	P19634	815 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SLC1A1	P43005	524 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	WNT7B	P56706	349 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PTGIS	Q16647	500 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ISM2	Q6H9L7	571 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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