RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 LIN9Q5TKA1 542 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 BRAPQ7Z569 592 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 KSR1Q8IVT5 923 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PGBD4Q96DM1 585 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RIT2Q99578 217 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 VAV3Q9UKW4 847 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MYH11P35749 1972 aa8.21□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.21□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 EML1O00423 815 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF263O14978 683 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CHADO15335 359 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 GAS7O60861 476 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 WISP1O95388 367 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 F13A1P00488 732 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 NTRK1P04629 796 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ENGP17813 658 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 BCKDHBP21953 392 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 DNM2P50570 870 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 IL17AQ16552 155 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 COLEC12Q5KU26 742 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 RABGGTAQ92696 567 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 SMARCD2Q92925 531 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 FAM20AQ96MK3 541 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 WDR70Q9NW82 654 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 EBF1Q9UH73 591 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ARL5CA6NH57 179 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 STBD1O95210 358 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 OR52Z1P0C646 297 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 SFNP31947 248 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 TXKP42681 527 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 MAPK8P45983 427 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 JAK3P52333 1124 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CDC42EP1Q00587 391 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CREMQ03060 361 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CYP4F3Q08477 520 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 PPP2R5CQ13362 524 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 PTPAQ15257 358 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CALCRLQ16602 461 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 XKR3Q5GH77 459 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 RTL10Q7L3V2 364 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ZFP42Q96MM3 310 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 NLRP4Q96MN2 994 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 HHIPQ96QV1 700 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 USP28Q96RU2 1077 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 GAD1Q99259 594 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 SNTG2Q9NY99 539 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 CLIC4Q9Y696 253 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 FLNCQ14315 2725 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-204ENST00000495399 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms