RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR24Q96S15 920 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CGRRF1Q99675 332 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CDT1Q9H211 546 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 GANQ9H2C0 597 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 GCNT4Q9P109 453 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GVG6 124 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 B4GALT5O43286 388 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 IQCF3P0C7M6 154 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PON1P27169 355 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CDK17Q00537 523 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 KRT72Q14CN4 511 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX17Q15036 470 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPN21Q16825 1174 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 EPC2Q52LR7 807 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF394Q53GI3 561 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM26DQ5JW98 314 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 KRT39Q6A163 491 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 NOTUMQ6P988 496 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM139Q8IV31 216 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 WHAMMQ8TF30 809 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 FNBP1Q96RU3 617 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TCHPQ9BT92 498 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 GALNT8Q9NY28 637 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 C2CD2Q9Y426 696 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 SQORQ9Y6N5 450 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PQY0 241 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 EVI5O60447 810 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 NOL4O94818 638 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CLTAP09496 248 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 GGCXP38435 758 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK7P49862 253 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 DLG4P78352 724 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP3CAQ08209 521 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 MGAT3Q09327 533 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CBX3Q13185 183 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 MEA1Q16626 185 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PTGISQ16647 500 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CBWD6Q4V339 395 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 PDXDC1Q6P996 788 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ZBTB33Q86T24 672 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR49Q8IV35 697 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CD302Q8IX05 232 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 OSMRQ99650 979 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 SIX2Q9NPC8 291 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 B4GALT4O60513 344 aa7.68□□□□□ -1.18
SMARCE1-211ENST00000493660 CTAGE8P0CG41 777 aa7.68□□□□□ -1.18
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