RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.48□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 SUSD6Q92537 303 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GLG1Q92896 1179 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ITFG2Q969R8 447 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.48□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 PCNTO95613 3336 aa7.48□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.48□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GPD1LQ8N335 351 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 HELQQ8TDG4 1101 aa7.48□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.48□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF233A6NK53 670 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF10AO00220 468 aa7.47□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TLK2Q86UE8 772 aa7.47□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 H3BNC9 293 aa7.47□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 STRN3Q13033 797 aa7.47□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 ITGA7Q13683 1181 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TTMPQ5BVD1 217 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 DEPTORQ8TB45 409 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ZNF516Q92618 1163 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NELL1Q92832 810 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CAVIN3Q969G5 261 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NUP85Q9BW27 656 aa7.47□□□□□ -1.21
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HERC4-211ENST00000492996 ELF1P32519 619 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G5P39877 138 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 PEX19P40855 299 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NEDD9Q14511 834 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SHHQ15465 462 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ARMC3Q5W041 872 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 METTL7BQ6UX53 244 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 PASD1Q8IV76 773 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TCHPQ9BT92 498 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ISCUQ9H1K1 167 aa7.46□□□□□ -1.21
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