RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491297.6

WDR78-208, Transcript of WD repeat domain 78, human

TSL 2

Gene WDR78, Length 4,206 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WDR78-208	ENST00000491297	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CARD9	Q9H257	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	ERLIN1	O75477	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCDH8	O95206	1070 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CD33	P20138	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	VPS41	P49754	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	NT5C2	P49902	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TNIP1	Q15025	636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	MED22	Q15528	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	KYNU	Q16719	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CEP68	Q76N32	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	MARVELD3	Q96A59	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	NELL2	Q99435	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	EYA3	Q99504	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CEP72	Q9P209	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297		H7C0S8	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	RAB27B	O00194	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PROM1	O43490	865 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	AKR1B10	O60218	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	GMNN	O75496	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
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WDR78-208	ENST00000491297	CSH2	P0DML3	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
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WDR78-208	ENST00000491297	CASP5	P51878	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
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WDR78-208	ENST00000491297	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PTK6	Q13882	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SCARF1	Q14162	830 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	SEC23A	Q15436	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	PCSK7	Q16549	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR78-208	ENST00000491297	CDC14C	A4D256	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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