RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 KCNK12Q9HB15 430 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 DMAC2Q9NW81 257 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 EPS15L1Q9UBC2 864 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SORCS3Q9UPU3 1222 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 YIPF1Q9Y548 306 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SNX9Q9Y5X1 595 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MTMR11A4FU01 709 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TMEM221A6NGB7 291 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 M0R296 226 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SOAT2O75908 522 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 LAMP2P13473 410 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PTPN2P17706 415 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 COL9A1P20849 921 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MTMR3Q13615 1198 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CENPPQ6IPU0 288 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 HFE2Q6ZVN8 426 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 LRRTM3Q86VH5 581 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 OSTM1Q86WC4 334 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 THEM5Q8N1Q8 247 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 FGF13Q92913 245 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TCEAL4Q96EI5 215 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CEP72Q9P209 647 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CDH7Q9ULB5 785 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MAFFQ9ULX9 164 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PRR33A8MZF0 331 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 HCRTO43612 131 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 NARSO43776 548 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CALUO43852 315 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CST3P01034 146 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CEBPBP17676 345 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MYO1EQ12965 1108 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TDGQ13569 410 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CEP135Q66GS9 1140 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 POTEHQ6S545 545 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SLC9A9Q8IVB4 645 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 UBALD2Q8IYN6 164 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ELMOD1Q8N336 334 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TMLHEQ9NVH6 421 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MUC6Q6W4X9 2439 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 KIF20AO95235 890 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SMC2O95347 1197 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MYL4P12829 197 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CCR2P41597 374 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ALDH1A3P47895 512 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 DLG4P78352 724 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TSPY1Q01534 308 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 BIRC3Q13489 604 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 HTR4Q13639 388 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CCDC142Q17RM4 750 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 IQCEQ6IPM2 695 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PARM1Q6UWI2 310 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ADGRF2Q8IZF7 708 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TMEM86AQ8N2M4 240 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PARD3BQ8TEW8 1205 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TMEM174Q8WUU8 243 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 MCRS1Q96EZ8 462 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ASIC4Q96FT7 647 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TIGD1Q96MW7 591 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 IGSF9Q9P2J2 1179 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 NUMBLQ9Y6R0 609 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-214ENST00000490425 ANHXE9PGG2 379 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 KINO60870 393 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PHACTR2O75167 634 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GJA1P17302 382 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 NR2F2P24468 414 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PRCPP42785 496 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MYL6P60660 151 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MYL7Q01449 175 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PLD1Q13393 1074 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TRPC3Q13507 836 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms